À Douarnenez, la localisation d’un port antique reste sujet à débat. Certains chercheurs le place à la plage du Ry tandis que d’autres le situe le long des quais actuels de Port Rhu, sur l’ancienne ria de Pouldavid. Ces deux localisations offrent des sites d’échouage bien abrités des vents et des courants violents, ainsi qu’un accès facile (Langouët 2002 : 90). Ces hypothèses de localisation s’appuient également sur la présence d’une dense occupation da la frange littorale à l’époque romaine. À commencer par la mise au jour en 1948 d’une inscription faisant mention « d’une assemblée de citoyens probablement liée à cette industrie du garum et des salaisons » (Langouët 2002 : 90). De plus, deux voies antiques qui desservent bien la ville ainsi que la plage du Ry. Il faut préciser que ces axes restitués grâce à un travail cartographique, ne sont pas attestés par l’archéologie (Monteil 2012 : 146). Il s’agit d’abord de l’axe reliant Carhaix à Douarnenez selon une orientation ouest/ est, et qui passe à proximité de la plage du Ry. En fond de baie, la voie traverse le ruisseau de Névet au moyen d’un passage à gué. Autour de ce dernier se sont probablement installées une à plusieurs usines de salaisons, associées à une villa (Galliou 2010 : 194). Un peu plus à l’ouest, dans le village de Plomarc’h, un ensemble de plusieurs bâtiments a été mis au jour lors de fouilles dans les années 2000. Ce site antique a livré plusieurs cuves de salaisons, 28 au total, installées au IIe siècle après J.-C. Elles fonctionnent jusqu’à la fin du IIIe siècle après J.-C. puis sont abandonnées. Ce site est ensuite réoccupé par un habitat un siècle plus tard (Galliou 2020 : 192-193).

La voie antique Quimper-Douarnenez (nord-ouest/ sud-est) dessert le site de Port Rhu, seconde hypothèse d’implantation d’un port antique. Une multitude de vestiges archéologiques est reconnue à proximité, notamment des structures maçonnées et des productions salicoles. L’une d’entre elles, mises au jour en 1889, a livré « deux séries d’au moins 5 cuves », ainsi qu’une statue d’Hercule en calcaire (Galliou 2010 : 189). Deux villae ont également été identifiées à l’embouchure de la ria et plus au sud sur le plateau qui domine Port Rhu.

Cette forte densité d’établissements de production de sauces et de salaisons de poissons bien desservit par un carrefour routier au sud de Plomarc’h et associée à de nombreux autres points de découvertes de part et d’autre de l’ancienne ria Pouldavid (éléments d’architecture, céramiques, restes de constructions), suggèrent qu’une agglomération romaine ait pu s’établir le long du littoral ou plus en retrait en fond de ria, vers le temple romain de Trogouzel. Des nécropoles sont également avérées à Douarnenez, entre la ria et le site du Ry. 

Sur la commune, quelques indices suggèrent une occupation de Douarnenez dès l’âge du Fer (des antécédents mal caractérisés sous le temple de Trogouzel, des stèles et une exploitation agricole à hauteur de l’actuel port de plaisance), mais qui semble moins étendue et moins dense. Actuellement, ces vestiges peuvent difficilement être mis en relation avec une activité portuaire antérieure à l'époque romaine.

Pour le Moyen Âge, cinq ports sont mentionnés par M. Tranchant : Tréboul, Port Rhu, Pouldavid, port Commoneue et Ploaré (Tranchant 2017 : 99). Le premier, Port Rhu, est situé près de l’actuel port-musée de Douarnenez. Le deuxième, Pouldavid, localisé au fond de la ria du même nom, a appartenu aux seigneurs de Nevet, tout comme le Port Rhu et celui de Tréboul. Sa localisation exacte n’est pas connue par manque d’indices archéologiques ou de sources écrites. Cependant, M. Tranchant signale qu’il a été aménagé à l’entrée de la ria, tout comme le Port Rhu (Tranchant 2017 : 99). Le port Commoneue apparaît dans les textes à partir de 1306 sous ce nom. Il appartient alors aux moines de Marmourtier, établis sur l’île Tristan depuis la fondation de leur prieuré. Le port est actif jusque dans les années 1520-1540, moment où il est à nouveau signalé dans les textes. Il semble qu’il soit aujourd’hui sous l’actuel port Rosmeur. Le dernier port, celui de Ploaré n’est mentionné que très rarement. Peu d’informations à son sujet permettent de le localiser précisément.